Avšak akvakultura představuje problémy a obavy, které je třeba řešit, zvláště pokud se uvažuje o zapojení do tohoto odvětví
Různé problémy, které představuje akvakultura
Zde je pět běžných problémů spojených s akvakulturou.
Životní prostředí: Podobně jako obrovské akvárium žijí pozemní rybí farmy v nádržích obsahujících špinavou vodu, která musí být změněna. V závislosti na nastavení systému může dojít k vypouštění významných množství odpadních vod obsahujících výkaly, živiny a chemické látky uvolněné do životního prostředí. Uvolnění této látky může vést k rozkvětem řas, které nakonec odstraní rozpuštěný kyslík v přijímací vodní cestě nebo eutrofizaci. Nulový obsah kyslíku způsobuje smrtelné zabíjení ryb.
Dále se v průmyslu akvakultury běžně používají chemikálie, jako jsou antibiotika a činidla pro úpravu vody, a systémy akvakultury je třeba uzavřít nebo před vypouštěním zpracovávat odpadní vody.
Onemocnění: Akvakultura může šířit parazity a onemocnění do přírody. Stejně jako komerční kuřata musí být udržovány čisté a známé pro šíření choroby, farmářské ryby a měkkýši podléhají stejným okolnostem.
Také chované ryby mají větší šanci na získávání parazitů, jako jsou mořské vši, na rozdíl od ryb, které žijí a chovají se v jejich přirozeném prostředí.
Chovné ryby jsou rovněž vystaveny onemocnění použitím nezpracovaných ryb používaných jako zdroj potravy, na rozdíl od bezpečnějších zpracovaných rybích pelet.
Escapees: Akvakultura je jednou z největších příčin vzniku cizích druhů v nových oblastech, které vytvářejí invazivní druhy za správných podmínek.
Farmářská ryba může uniknout z pera, což poškozuje životní prostředí a ohrožuje populaci obyvatel domácích ryb.
Výsledkem je, že utečené farmové ryby mohou soutěžit o jídlo a životní prostředí, vytlačit domorodé druhy a zasahovat do života divokých druhů. Mohou také přenášet nemoci a parazity, které by mohly zabíjet původní druhy. Kromě toho se mohou farmářské ryby, které unikly, chovat s divokou populací, která může zředit přírodní genofond a ohrozit dlouhodobé přežití a vývoj divokých druhů.
Sekundární dopady: Vzhledem k tomu, že chované ryby potřebují zdroj potravy, ostatní volně žijící druhy jsou ohroženy nadměrným odlovem pro výrobu rybích potravin. Protože většina farmových ryb je masožravá, krmí se buď celá ryba nebo pelety z ryb. Druhy, jako je makrela, sleď a treska bezvousá, jsou ohroženy kvůli potřebě vytvářet potravu pro farmové druhy.
Důsledky výstavby: jak pozemní, tak i vodní volně žijící živočichové mohou ztratit své stanoviště budováním zařízení pro akvakulturu podél pobřežního majetku, kde je pro své procesy přístupná čistá a přírodní voda. V jednom slavném příkladu, v Asii a Latinské Americe, mangrovové lesy byly vyčištěny, aby poskytly prostor pro krevetové farmy.